ВЫЯВЛЕНИЕ СВЯЗИ СТРУКТУРЫ И ТАКСОНОМИИ ГЕНОМОВ ХЛОРОПЛАСТОВ МЕТОДОМ ДИНАМИЧЕСКИХ ЯДЕР

Перевод названия: REVEALING THE RELATIONS BETWEEN CLOROPLAST AND HOST GENOMES WITH K-MENAS TECHNIQUE

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2014

Ключевые слова: order, triplet, frequency, classification, correlation, taxonomy, evolution, порядок, триплет, частота, классификация, корреляция, таксономия, эволюция

Аннотация: Представлены предварительные результаты исследования связи геномов хлоропластов с геномами организмов-носителей. 251 геном хлоропластов преобразовывался в частотные словари триплетов, затем в 63-мерном пространстве этих частот строилась классификация методом динамических ядер (до восьми классов). Полученные классы сравнивались по своему составу. Установлено, что видовой состав полученных классов не случаен: группы, полученные при делении, содержат эволюционно близкие группы геномов. Состав классов, выделяемых методом динамических ядер, оказался весьма устойчивым: доля волатильных геномов не превышала 20?% в худшем случае. Эта корреляция доказывает факт сильной синхронии в эволюции геномов хлоропластов и соматических геномов, поскольку кластеризация в пространстве частот проводилась по геномам хлоропластов, а определение таксономической близости – по морфологическим признакам (т.е. по соматическому геному).

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Фундаментальные исследования

Выпуск журнала: 11-3

Номера страниц: 545-549

ISSN журнала: 18127339

Место издания: Пенза

Издатель: Общество с ограниченной ответственностью "Издательский Дом "Академия Естествознания"

Авторы

  • Садовский М.Г. (ФГБУН «Институт вычислительного моделирования» Сибирского отделения Российской академии наук)
  • Чернышова А.И. (ФГАОУ «Сибирский федеральный университет»)

Вхождение в базы данных

Информация о публикациях загружается с сайта службы поддержки публикационной активности СФУ. Сообщите, если заметили неточности.

Вы можете отметить интересные фрагменты текста, которые будут доступны по уникальной ссылке в адресной строке браузера.